En gang ved siden af Salle des Gens d'Armes ved navn Rue de Paris går hen til fængselsområdet. Køkkenet, som ligger lavt ud mod Quai de l'Horloge og Seinen, har et ildsted i hvert hjørne. Det er fra den oprindelige bygning fra ca. midten af 1300-tallet. Facaden mod Seinen er opført i 1800-tallet i nygotisk stil.
Under Revolutionen i 1789 blev mange fængslet her. Næsten 2600 fanger blev dødsdømt og herfra kørt til guillotinen, som stod forskellige steder i byen.
I 1914 blev en del af fængslet lavet om til et museum. I 1989 blev det lavet om, hvor f.eks. flere rum blev rekonstrueret. Dermed kunne man se, hvordan cellerne havde set ud omkring Revolutionen, hvor der b.la. kan ses en rekonstruktion af Marie-Anotinette's celle. I flere af cellerne er der voksfigurer af personer. Og på 1. sal fortælles om bygningens historie, bl.a. om de kendte fanger der sad her.
Adresse: Quai de l'Horloge 1 (île de la Cité & île St-Louis)